维生素B12吸收入血液后即与转钴胺相结合，转入组织中。转钴胺有三种，其中转钴胺Ⅱ是维生素B12转运的主要形式，占血浆中维生素B12总含量的2/3。肝脏是维生素B12的主要贮存部位。人体内维生素B12贮存总量为3~5mg，其中1~3mg贮于肝脏。口服维生素B12，24小时后肝中维生素B12的浓度达到高峰。5~6日后，约有用量的60~70%仍集中在肝脏。主要经肾，除肌体需求量外，几乎皆以原形随尿排出。肌注维生素B12 1mg，72小时后，总量的75%以原形随尿排出。尿排出量随注入量而增加，肌注5μg后，8小时排出3~4μg；肌注1mg后，8小时排出量可达330~470μg。